Connaissance Enseignement du bioprocessus et de la biotechnologie Comment la croissance des moisissures mycéliennes influence-t-elle le transfert de masse et l'apport en oxygène dans les réacteurs pilotes de bioprocédés ? Aperçus clés
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Équipe technique · LABPARK

Mis à jour il y a 2 mois

Comment la croissance des moisissures mycéliennes influence-t-elle le transfert de masse et l'apport en oxygène dans les réacteurs pilotes de bioprocédés ? Aperçus clés


La croissance des moisissures mycéliennes peut faire du transfert d'oxygène la limitation principale dans un réacteur pilote. Le réseau d'hyphes ramifiés augmente la viscosité du bouillon, crée un écoulement non newtonien et accroît la résistance au mélange et au transfert de masse gaz-liquide. À mesure que la concentration en biomasse et la respiration augmentent, le réacteur peut devenir incapable de fournir de l'oxygène aussi rapidement que la culture le consomme, même lorsque l'aération et l'agitation semblent importantes.

Le problème central est l'équilibre entre le taux de transfert d'oxygène et le taux de consommation d'oxygène. Les mycéliums dispersés créent généralement la plus grande résistance à l'écoulement global et au mélange, tandis que les pelotes (pellets) peuvent améliorer le mélange global mais développent des barrières de diffusion internes qui privent leurs cœurs d'oxygène et de nutriments.

Pourquoi la morphologie mycélienne modifie le transport dans le réacteur

La croissance hyphale dispersée augmente la résistance à l'écoulement

Le mycélium de moisissure consiste en de longs filaments hautement ramifiés appelés hyphes. Lorsque ces hyphes restent dispersés, ils forment une structure interconnectée dans toute la phase liquide.

Cette structure augmente la viscosité apparente et produit un comportement non newtonien, ce qui signifie que le bouillon ne s'écoule pas proportionnellement au cisaillement appliqué. La résistance à l'écoulement peut donc varier en fonction de la vitesse de l'agitateur, de la position dans la cuve et des conditions locales de cisaillement.

Un bouillon dense réduit l'efficacité du mélange

Une viscosité plus élevée rend plus difficile la circulation de l'ensemble du volume du réacteur par l'agitateur. Une mauvaise circulation augmente les gradients de concentration et peut créer des zones où le liquide riche en oxygène provenant de la surface ou des bulles n'atteint pas les cellules efficacement.

Le résultat est une différence plus importante entre la concentration locale en oxygène dissous et la mesure moyenne dans la cuve. Une sonde à oxygène dissous peut indiquer des conditions moyennes acceptables alors que des zones mal mélangées subissent un épuisement en oxygène.

Les réseaux hyphaux interfèrent avec la dispersion des bulles

Le transfert d'oxygène gaz-liquide dépend de l'exposition du liquide à une interface gaz-liquide suffisamment grande et renouvelable. Les suspensions mycéliennes denses peuvent altérer le comportement de rupture, de circulation et de coalescence des bulles.

Ces changements peuvent réduire la dispersion efficace du gaz et abaisser le coefficient de transfert d'oxygène volumétrique, (k_La). L'effet dépend de la viscosité du bouillon, de sa rhéologie, du comportement interfacial, de la configuration de l'agitateur et des conditions de bullage.

Comment l'apport en oxygène devient limité

L'oxygène a une faible solubilité dans le bouillon

L'oxygène n'est que très peu soluble dans les milieux de culture aqueux. Le réacteur doit transférer en continu l'oxygène des bulles de gaz vers le liquide, puis le transporter du liquide vers le mycélium en croissance.

Le taux de transfert d'oxygène disponible est généralement représenté comme suit :

[ \mathrm{OTR} = k_La(C^* - C_L) ]

où (k_La) est le coefficient de transfert de masse volumétrique, (C^*) est la concentration d'oxygène dissous à l'équilibre, et (C_L) est la concentration réelle d'oxygène dissous en phase liquide.

La respiration peut dépasser le transfert

À mesure que la densité de la biomasse et la disponibilité des nutriments augmentent, la respiration cellulaire peut s'élever rapidement. L'oxygène devient limitant lorsque le taux de consommation d'oxygène de la culture dépasse le taux de transfert d'oxygène du réacteur.

Cette condition peut abaisser l'oxygène dissous dans tout le réacteur ou produire des zones localisées appauvries en oxygène. Dans les cas graves, des zones anaérobies peuvent se former à l'intérieur des agrégats ou dans des volumes de réacteur mal mélangés, modifiant le métabolisme et réduisant la cohérence du processus.

Le changement d'échelle amplifie le problème

Un réacteur pilote ne reproduit pas nécessairement l'environnement de transfert d'oxygène d'une cuve de laboratoire. Les changements dans la géométrie de la cuve, la taille de l'agitateur, l'apport de puissance, le débit de gaz et les propriétés du liquide peuvent altérer les modèles de circulation et le (k_La).

Un processus qui reste suffisant en oxygène à petite échelle peut donc devenir limité par le transport lors du changement d'échelle. La comparaison pertinente n'est pas simplement le taux d'aération nominal, mais de savoir si le transfert d'oxygène reste adéquat dans les conditions de mélange et rhéologiques du système plus grand.

Comment la formation de pelotes (pellets) modifie le résultat

Les pelotes créent des barrières de diffusion internes

Les champignons filamenteux peuvent croître sous forme d'hyphes dispersés ou former des agrégats denses appelés pelotes. Les pelotes peuvent varier d'environ 50 micromètres à 1 millimètre de diamètre.

À l'intérieur d'une pelote, l'oxygène et les nutriments doivent diffuser depuis le liquide environnant vers le centre. La masse cellulaire dense augmente le chemin de diffusion et peut laisser le cœur de la pelote limité en oxygène, même lorsque le liquide environnant a une concentration adéquate en oxygène dissous.

Les pelotes peuvent améliorer le mélange global

La croissance sous forme de pelotes peut réduire considérablement la viscosité globale du bouillon par rapport à la croissance filamenteuse dispersée. Une viscosité plus faible améliore généralement la circulation globale et peut renforcer le transfert d'oxygène gaz-liquide.

Cela crée un compromis : les pelotes peuvent rendre le réacteur plus facile à mélanger tout en créant simultanément des limitations de transport internes. La morphologie préférée est donc une variable de processus, et non une simple description visuelle de la culture.

La morphologie lie la biologie et la conception de l'équipement

Les mêmes conditions de réacteur qui affectent le transfert d'oxygène peuvent également affecter la morphologie fongique. L'agitation, le bullage, le cisaillement, les conditions nutritionnelles et la géométrie du réacteur influencent le fait que la croissance reste dispersée ou forme des pelotes.

La morphologie rétroagit ensuite sur la viscosité, le mélange, le comportement des bulles et la demande en oxygène. L'optimisation du pilote doit évaluer cette interaction biologique et technique ensemble.

Comment les ingénieurs évaluent le transfert d'oxygène

Utiliser des fluides de test pertinents pour le bouillon

Les tests sans cellules peuvent caractériser le transfert d'oxygène sans la demande supplémentaire en oxygène de la biomasse vivante. Cependant, le liquide synthétique doit reproduire les propriétés importantes du bouillon, notamment la viscosité, la rhéologie, la solubilité et la diffusivité de l'oxygène, la résistance à l'interface gaz-liquide et le comportement de coalescence des bulles.

Tester uniquement avec de l'eau peut fausser la performance lorsque le bouillon de moisissure réel est visqueux ou fortement non newtonien. Le (k_La) mesuré doit être pertinent pour le fluide que l'organisme rencontrera réellement.

Combiner les mesures d'oxygène dissous et de gaz de sortie

Les électrodes à oxygène dissous polarographiques stérilisables peuvent suivre la concentration locale en oxygène en phase liquide. Les mesures prises en faisant varier la vitesse de l'agitateur et le taux de bullage aident à révéler comment les conditions d'exploitation affectent la disponibilité en oxygène.

L'analyse des gaz de sortie fournit une mesure complémentaire à l'échelle de la cuve. Sous un débit de gaz continu, la consommation d'oxygène peut être estimée à partir des débits de gaz d'entrée et de sortie et des pressions partielles d'oxygène :

[ Q_{O_2} = \frac{F_{g,\mathrm{entrée}}(p_{O_2})_{\mathrm{entrée}}

F_{g,\mathrm{sortie}}(p_{O_2})_{\mathrm{sortie}}} {VRT} ]

Ce bilan en phase gazeuse peut être comparé aux mesures d'oxygène dissous pour distinguer la demande globale en oxygène des gradients locaux d'oxygène.

Interpréter les données des sondes avec précaution

Une seule sonde à oxygène dissous rapporte les conditions à un endroit précis. Dans un bouillon mycélien très visqueux ou mal mélangé, cet endroit peut ne pas représenter l'ensemble du réacteur.

Une évaluation fiable prend donc en compte à la fois le comportement local de l'oxygène dissous et le transfert d'oxygène moyenné dans la cuve. L'analyse des gaz de sortie, des emplacements de mesure multiples lorsque cela est pratique, et les observations morphologiques fournissent une image plus complète.

Comprendre les compromis

Plus d'agitation améliore le transfert mais augmente le cisaillement

L'augmentation de la vitesse de l'agitateur peut améliorer la circulation, la dispersion des gaz et le (k_La). Cela augmente également la demande en puissance et peut altérer la rupture des hyphes ou la structure des pelotes.

Le taux d'agitation le plus élevé n'est pas automatiquement le meilleur point de fonctionnement. Le réglage approprié doit fournir un transfert d'oxygène suffisant tout en préservant la morphologie et les caractéristiques du produit requises par le processus.

Plus d'aération ne garantit pas une oxygénation adéquate

L'augmentation du débit de gaz peut accroître la disponibilité en oxygène et améliorer le transfert dans certaines conditions. Cependant, le bénéfice dépend de la dispersion des bulles, du temps de séjour, de la coalescence, de la géométrie du réacteur et de la rhéologie du bouillon.

L'aération doit donc être évaluée par la performance de transfert d'oxygène mesurée plutôt que traitée comme une variable de contrôle isolée.

Les pelotes améliorent les propriétés globales mais peuvent limiter leurs cœurs

Les cultures en pelotes réduisent souvent la viscosité globale et améliorent le mélange à l'échelle du réacteur. Leurs intérieurs denses, cependant, peuvent rester limités par la diffusion d'oxygène et de nutriments.

Surveiller uniquement l'oxygène dissous global peut masquer cette limitation interne. La taille et la structure des pelotes doivent être prises en compte parallèlement au (k_La), à la consommation d'oxygène et à la formation du produit.

Une suffisance apparente en oxygène peut cacher un épuisement local

L'oxygène dissous moyen peut rester acceptable alors que les cellules dans les zones stagnantes ou les centres des pelotes subissent un faible taux d'oxygène. Ces gradients peuvent produire un métabolisme hétérogène et un comportement de changement d'échelle incohérent.

Les études pilotes devraient donc examiner les effets de transport spatial, surtout lorsque le bouillon est dense, très visqueux ou morphologiquement instable.

Faire le bon choix pour votre objectif

La stratégie d'exploitation correcte dépend de la priorité : apport global en oxygène, contrôle de la morphologie ou changement d'échelle fidèle.

  • Si votre objectif principal est de maximiser le transfert global d'oxygène : Optimisez la conception de l'agitateur, l'agitation, le bullage et la géométrie du réacteur ensemble tout en mesurant le (k_La) dans un fluide pertinent pour le bouillon.
  • Si votre objectif principal est de contrôler la morphologie fongique : Suivez la formation d'hyphes dispersés par rapport aux pelotes, car la morphologie modifie directement la viscosité, le mélange, le transfert d'oxygène et la diffusion interne.
  • Si votre objectif principal est de détecter la limitation en oxygène : Comparez la consommation d'oxygène issue de l'analyse des gaz de sortie avec les mesures locales d'oxygène dissous plutôt que de vous fier à une seule valeur de sonde.
  • Si votre objectif principal est de changer l'échelle du processus : Reproduisez la rhéologie, la dispersion des gaz, la demande en oxygène et la morphologie pertinentes à l'échelle pilote au lieu de transférer les réglages de laboratoire sans modification.

Le succès de l'exploitation d'une unité pilote nécessite de traiter la morphologie mycélienne, la mécanique des fluides et la demande en oxygène comme un seul problème de transport couplé.

Tableau récapitulatif :

Facteur Effet sur le transfert d'oxygène Considération technique
Hyphes dispersés Augmentent la viscosité et la résistance au mélange ; peuvent réduire le kLa Optimiser l'agitation, la conception de l'agitateur et le bullage
Formation de pelotes Améliore le mélange global mais peut causer un épuisement en oxygène dans les cœurs Contrôler la taille et la morphologie des pelotes
Rhéologie du bouillon L'écoulement non newtonien crée des gradients de concentration Tester le transfert d'oxygène en utilisant des fluides pertinents
Taux de transfert d'oxygène (OTR) Doit atteindre ou dépasser le taux de consommation d'oxygène cellulaire (OUR) Surveiller l'oxygène dissous et la composition des gaz de sortie
Changement d'échelle Les changements de géométrie, de puissance, de débit de gaz et de viscosité affectent le kLa Valider la performance de transport à l'échelle pilote
Agitation et aération Améliorent la circulation et la dispersion des gaz mais augmentent l'usage d'énergie et le cisaillement Équilibrer l'apport en oxygène, la morphologie et la qualité du produit

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